Membangun  kapasitas  dan  kapabilitas  suatu  lembaga  litbang  bereputasi  mencakup upaya-upaya  penguatan  kelembagaan  dan  sumberdaya  pendukung  baik  sumberdaya  manusia maupun  sarana  dan  prasarana  pendukung  seperti  laboratorium.  Penguatan  kelembagaan mencakup  penataan  organisasi  dan  pengembangan  aturan  main  internal  dan  tata hubungan dengan pihak eksternal lainnya.

Penguatan  kapasitas  lembaga  dilakukan  melalui  berbagai  kegiatan  termasuk  pengayaan dokumen  baik  dalam  bentuk  buku  maupun  proposal  unggulan  serta  penyesuaian  roadmap riset  agar  selalu  sesuai  kebutuhan  dan  perkembangan  teknologi.

Untuk penguatan  kapasitas  SDM  maka dilakukan  berbagai kegiatan  pelatihan bioteknologi reklamasi lahan. Guna mengatasi anggaran pengiriman peneliti P2T-Rekla untuk mengikuti  pelatihan,  maka  manajemen  P2T-Rekla  menerapkan  mekanisme  berantai.  Para peneliti  yang  dikirimkan  untuk  mengikuti  pelatihan  eksternal  diwajibkan  untuk mendistribusikan  pengetahuan  yang  mereka  peroleh  dengan  menjadi  narasumber  (trainer) pada pelatihan eksternal.

Pada  sisi  lain,  guna  menggali  sumber-sumber  pendanaan  kegiatan  litbang  alternatif  maka dikembangkan  forum  diskusi  proposal  dan  penguatan  roadmap  litbang.  Forum  diskusi proposal  dilakukan melalui mekanisme diskusi  terbuka  antara  peneliti  penulis  usulan  (tim atau perseorangan) dengan peneliti lainnya dibawah supervisi tim reviewer yang dibentuk dan ditunjuk  oleh  P2T-Rekla.  Output  utama  dari  forum  diskusi  adalah  berupa proposal unggulan  tekait  iptek reklamasi  lahan yang siap diajukan untuk berbagai  sumber  pendanaan  atau  skim  hibah  DPRM  Ristek  Dikti.